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Metabolic Pathways - L-Lysin Biosynthese

Die Abbildung ist ein Screenshot der interaktiven Karte der KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. An diesem Beispiel wird demonstriert, wie die KEGG-Datenbank aufgebaut ist. In Form eines INTERFACE zu ihr wird gezeigt, wie man einen vollständigen Zugang zu den Daten dieser Datenbank - d.h. zu allen am Stoffwechsel beteiligten Enzymen sowie den Intermediär- und Endprodukten erhalten kann


Dieser Kartenausschnitt enthält eine Vielzahl detaillierter Angaben. So enthält er die Namen der Verbindungen der Intermediär- und Stoffwechselendprodukte. Durch Anklicken des jeweiligen Kreises (Beispiel: Lysin) gelangt man zu einem Datenblatt, auf dem die Formel und die molekularen Eigenschaften der Verbindung aufgeführt sind. Ferner enthält das Datenblatt Angaben über Enzyme, die die jeweilige Verbindung umsetzen können.

Die biochemischen Reaktionen werden durch Enzyme katalysiert. Auf dem Kartenausschnitt sind sie als Ziffern wiedergegeben. Die Ziffern entstammen der EC-Nomenklatur. Durch Anklicken der entsprechenden Box gelangt man zu dem Datenblatt mit den Enzymangaben. Von dort wiederum gelangt man zu allen Daten, die für das jeweilige Enzym vorliegen. - Die Links auf den hier ausgewählten Datenblättern führen direkt zu den von KEGG vorgenommenen Eintragungen.

Die nachfolgenden Listen dienen dazu, einen systematischen Zugang zu allen Datenbankeintragungen von KEGG - Metabolic Pathways - zu erhalten (alle Links führen direkt zur Datenbank in Kyoto/Japan!)


KEGG Metabolic Pathways

Graphical pathway maps and ortholog group tables

Metabolism

Carbohydrate Metabolism
Glycolysis / Gluconeogenesis Ortholog
Citrate cycle (TCA cycle) Ortholog
Pentose phosphate cycle Ortholog
Pentose and glucuronate interconversions Ortholog
Fructose and mannose metabolism Ortholog
Galactose metabolism Ortholog
Ascorbate and aldarate metabolism Ortholog
Pyruvate metabolism Ortholog
Glyoxylate and dicarboxylate metabolism Ortholog
Propanoate metabolism Ortholog
Butanoate metabolism Ortholog
C5-Branched dibasic acid metabolism
Energy Metabolism
Oxidative phosphorylation
Methane metabolism Ortholog
Carbon fixation
Reductive carboxylate cycle (CO2 fixation)
Nitrogen metabolism Ortholog
Sulfur metabolism Ortholog
Lipid Metabolism
Fatty acid biosynthesis (path 1) Ortholog
Fatty acid biosynthesis (path 2)
Fatty acid metabolism
Synthesis and degradation of ketone bodies
Sterol biosynthesis
Bile acid biosynthesis
C21-Steroid hormone metabolism
Androgen and estrogen metabolism
Nucleotide Metabolism
Purine metabolism Ortholog
Pyrimidine metabolism Ortholog
Nucleotide sugars metabolism Ortholog
Aminosugars metabolism Ortholog
Amino Acid Metabolism
Glutamate metabolism Ortholog
Alanine and aspartate metabolism Ortholog
Glycine, serine and threonine metabolism Ortholog
Methionine metabolism Ortholog
Cysteine metabolism Ortholog
Valine, leucine and isoleucine degradation Ortholog
Valine, leucine and isoleucine biosynthesis Ortholog
Lysine biosynthesis Ortholog
Lysine degradation
Arginine and proline metabolism Ortholog
Histidine metabolism Ortholog
Tyrosine metabolism
Phenylalanine metabolism Ortholog
Tryptophan metabolism
Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis Ortholog
Urea cycle and metabolism of amino groups Ortholog
Metabolism of Other Amino Acids
beta-Alanine metabolism Ortholog
Taurine and hypotaurine metabolism
Aminophosphonate metabolism
Selenoamino acid metabolism
Cyanoamino acid metabolism
D-Glutamine and D-glutamate metabolism
D-Arginine and D-ornithine metabolism
D-Alanine metabolism
Glutathione metabolism
Alkaloid biosynthesis I
Alkaloid biosynthesis II
Metabolism of Complex Carbohydrates
Starch and sucrose metabolism Ortholog
Biosynthesis and degradation of glycoprotein
Peptideglycan biosynthesis Ortholog
Metabolism of Complex Lipids
Glycerolipid metabolism Ortholog
Inositol phosphate metabolism
Sphingophospholipid biosynthesis
Phospholipid degradation
Sphingoglycolipid metabolism
Prostaglandin and leukotriene metabolism
Metabolism of Cofactors, Vitamins, and Other Substances
Thiamine metabolism Ortholog
Riboflavin metabolism
Vitamin B6 metabolism
Nicotinate and nicotinamide metabolism Ortholog
Pantothenate and CoA biosynthesis
Biotin metabolism Ortholog
Folate biosynthesis Ortholog
One carbon pool by folate Ortholog
Retinol metabolism
Porphyrin and chlorophyll metabolism Ortholog
Terpenoid biosynthesis
Xenobiotics metabolism
Ubiquinone biosynthesis Ortholog
Flavonoids, stilbene and lignin biosynthesis Ortholog
Metabolism of Macromolecules
Protein biosynthesis (bacteria)
Protein biosynthesis (eukaryotes)
Aminoacyl-tRNA biosynthesis Ortholog

Note - The ortholog group table contains only a subset of enzymes in the pathway map. The subset represents a correlated cluster of enzyme genes that appear in a localized area in the genome and that function at closely related positions in the reaction pathway.

[ KEGG Regulatory Pathways | KEGG Table of Contents ]

Last updated: August 11, 1998


Peter v. Sengbusch - b-online@botanik.uni-hamburg.de